Marqueurs pour la détection rapide de la maladie des tâches bactériennes dans les melons

Les souches d'Acidovorax citrulli sont responsables de l’apparition de la maladie des tâches bactériennes sur les fruits (BFB) dans les cultures de cucurbitacées et affectent significativement le melon ; jusqu'à 80 à 100 % de perte de production dans des conditions environnementales favorables, surtout pendant la saison des pluies et des fluctuations de température.  

Des scientifiques de l'Université Nationale de Sunchon en Corée du Sud) ont découvert des marqueurs moléculaires pour la détection rapide des souches d'A. citrulli. « En utilisant un test d'inoculation croisée, nous avons remarqué que deux souches coréennes d'A. citrulli, NIHHS15-280 et KACC18782, étaient très virulentes envers le melon mais le sont moins envers les autres cucurbitacées », explique un des scientifiques.

Le melon, la pastèque, le concombre et la citrouille ont été inoculés avec différentes souches d'A. citrulli. Les souches NIHHS15-280 et KACC18782 montrent une attaque uniquement vers les feuilles et les fruits du melon 12 et 7 jours après inoculation. Les symptômes typiques du BFB sont indiqués par des flèches blanches. 

Les génomes entiers de trois souches d'A. citrulli isolées du melon et de trois souches de pastèques ont été alignés, ce qui a permis de concevoir trois ensembles d'amorces (AcM13, AcM380 et AcM797) qui sont spécifiques aux souches hôtes du melon, à partir de trois gènes liés à la pathogénie. Ces amorces ont détectées avec succès à la fois la souche cible NIHHS15-280 dans les tests d'amplification en chaîne par polymérase (PCR) à une très faible concentration d'ADN g bactérien et les souches cibles provenant de tissus végétaux infectés artificiellement, sans nécessiter l'extraction d'ADN bactérien.

« Il s'agit du premier signalement de marqueurs moléculaires offrant une détection fiable, sensible et rapide des souches d'A. citrulli. Les scientifiques concluent que ces marqueurs peuvent détecter les souches de l'hôte du melon A. citrulli dans des champs asymptomatiques avant l'apparition des symptômes, permettant alors aux agriculteurs de prendre des mesures de lutte à temps, de tester la santé des semences avant la plantation et d'assurer un mouvement transfrontalier des semences indemnes pour la quarantaine.

Source : Md. Rafiqul Islam, Mohammad Rashed Hossain, Hoy-Taek Kim, Denison Michael Immanuel Jesse, Md. Abuyusuf, Hee-Jeong Jung, Jong-In Park, Ill-Sup Nou, « Development of Molecular Markers for Detection of Acidovorax citrulli Strains Causing Bacterial Fruit Blotch Disease in Melon » (Mise au point de marqueurs moléculaires pour la détection des souches d'Acidovorax citrulli causant des tâches bactériennes chez le melon), 2019, International Journal of Molecular Sciences, 20(11), 2715


Date de publication:
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