À l'automne 2022, des chercheurs grecs ont étudié un type de tomate appelé Ekstasis, cultivé à Aspropyrgos, Attiki, en Grèce. Ces tomates étaient infectées par le virus du fruit brun rugueux de la tomate. Les chercheurs ont utilisé une méthode appelée RNA-Seq pour analyser les échantillons en question. Ils ont isolé l'ARN (un type de matériel génétique) des feuilles des tomates en utilisant un kit spécial et une machine appelée Illumina Novaseq 6000 pour cette analyse. Lors de l'examen du matériel génétique de ces tomates, ils ont trouvé non seulement le ToBRFV, mais aussi deux autres virus : le Southern tomato virus (un type de virus connu sous le nom d'Amalgavirus) et le « Tomato fruit blotch virus » (ToFBV).
Le « Tomato fruit blotch virus » est un virus nouvellement identifié qui provoque une maturation inégale et tachetée accompagnée de fossettes et de taches sombres sur les tomates. Après avoir été identifié pour la première fois en 2018-2019 en Italie et en Australie, il a été signalé en Espagne, au Brésil, en Slovénie ainsi qu'en Tunisie. Il a été extrait d'échantillons stockés, faisant remonter sa présence en Italie à 2012, ont indiqué plus tôt les chercheurs belges.
Le ToFBV a été signalé dans d'autres pays comme l'Italie, l'Australie, le Brésil, l'Espagne, le Portugal, la Slovénie et la Tunisie et est relié à une maladie de la tomate. Toutefois, il est important de noter que les chercheurs n'ont pas prouvé que le ToFBV était à l'origine de la maladie chez ces tomates. Ils n'ont pas non plus confirmé s'il pouvait se propager mécaniquement ou par l'intermédiaire des semences.
Le ToFBV appartient à un groupe appelé Blunervirus, et son matériel génétique est constitué de quatre ARN monocaténaires à sens positif. En comparant le matériel génétique du ToFBV grec avec des isolats provenant d'autres régions, les chercheurs ont constaté qu'il présentait un degré élevé de similitude avec les isolats tunisiens et italiens.
Pour confirmer la présence du ToFBV, les chercheurs ont utilisé une technique appelée RT-PCR visant à amplifier une partie spécifique du matériel génétique. Cela leur a permis de vérifier que le ToFBV était bien présent dans les échantillons de tomates.
En outre, ils ont testé 11 échantillons de tomates provenant d'une serre en Crète et d'un champ en Eubée, en Grèce. Ceux-ci présentaient également des symptômes de taches sur les fruits. Lorsqu'ils ont essayé d'infecter d'autres plantes avec la sève de ces tomates (une manière de vérifier si le virus est transmis mécaniquement), aucun symptôme n'est apparu. Cela laisse supposer que le ToFBV ne se transmet pas mécaniquement.
Ils ont également vérifié la présence d'autres virus dans ces échantillons, mais n'ont trouvé que le ToFBV. Il est intéressant de noter que toutes les plantes étaient infestées par des acariens de la tomate, soupçonnés d'être un mode de propagation possible du virus.
C'est la première fois que le ToFBV est identifié comme infectant les tomates en Grèce. Cela constitue une préoccupation pour la culture de la tomate en raison de son association potentielle avec la maladie de la tache des fruits et de la transmission possible par les acariens.
Ce travail a été financé par le Secrétariat général à la recherche et à l'innovation dans le cadre du plan national de relance et de résilience « Grèce 2.0 » (code d'action TAEDR-0535675).
Cliquez ici pour consulter le rapport de recherche (en anglais).
