À la fin de l'été 2019, un grave foyer de pourriture des fruits a été observé dans les vergers commerciaux de pommes Pink Lady (>20 ha au total) dans la région d'Émilie-Romagne (Italie du Nord). Les symptômes sur le fruit sont apparus sous la forme de petites lésions circulaires rouges à brunes. L'incidence de la maladie a été de plus de 50 %.
Pour isoler l'agent causal, les pommes atteintes ont été collectées et de petites portions de chair de fruit ont été excisées et placées sur de la gélose dextrose à la pomme de terre (PDA). L'isolement de l'agent pathogène, l'identification morphologique et le séquençage de l'ADN ont été réalisés par des scientifiques de l'université de Wageningue.
Les plaques ont été incubées à 20°C dans l'obscurité, et des cultures pures ont été obtenues par transfert des extrémités des hyphes sur PDA. Les cultures ont montré un mycélium cotonneux gris clair à gris foncé, le dessous de la culture étant brunâtre et devenant noir avec l'âge. Les conidies étaient cylindriques, aseptisées, hyalines, arrondies aux deux extrémités, et de 12,5 à 20,0 × 5,0 à 7,5 μm.
« Les caractéristiques morphologiques étaient conformes aux descriptions des espèces de Colletotrichum du complexe d'espèces de C. gloeosporioides, y compris C. fructicola. Deux isolats représentatifs (PinkL2 & PinkL3) provenant de différentes pommes ont été identifiés par séquençage de gènes multilocus. De plus, l'ADN génomique a été extrait et le séquençage moléculaire a confirmé l'identité de ces isolats en tant que C. fructicola. Les mêmes résultats ont été obtenus par un test de pathogénicité ».
Le Colletotrichum fructicola, qui appartient au complexe d'espèces de C. gloeosporioides, est connu pour provoquer la pourriture amère de la pomme aux États-Unis, en Corée, au Brésil et en Uruguay. Il n'existe qu'un seul rapport sur la pourriture amère associée à C. fructicola sur la pomme en Europe (en 2019 en France). Cependant, C. fructicola est également l'agent potentiel de la tache foliaire Glomerella (GLS) de la pomme.
« C'est le premier signalement de C. fructicola sur pomme en Italie. Il est important de souligner que le complexe d'espèces de C. gloeosporioides est toujours en cours de résolution et que de nouvelles espèces sur pomme continuent d'être identifiées, par exemple C. chrysophilum qui est très étroitement apparenté à C. fructicola, comme le rapporte une étude de 2020. Même si les risques liés à cet agent pathogène sont élevés, la présence de C. fructicola dans les vergers de pommiers européens doit être évaluée et des stratégies de gestion doivent être élaborées », concluent les scientifiques.
Source : Marcel Wenneker, Khanh Pham, Engelien Kerkhof, Dalphy O.C. Harteveld, 'First report of preharvest fruit rot of ‘Pink Lady’ apples caused by Colletotrichum fructicola in Italy', 2021, Plant Disease.