Yelloway B.V., coentreprise entre Chiquita et KeyGene, a finalisé un pan-génome de la banane destiné à soutenir la sélection de variétés résistantes aux maladies et adaptées au climat.
Le pan-génome recense la variation génétique au sein de Musa acuminata, l'espèce à l'origine des variétés commerciales telles que Gros Michel et Cavendish. En cartographiant une diversité génétique plus large, le projet vise à permettre des décisions de sélection plus ciblées et à soutenir le développement de variétés à long terme.
© Chiquita
Yelloway a été créée pour élargir l'accès à la diversité génétique de la banane et faire progresser la sélection classique grâce aux technologies génomiques. Le pan-génome a été développé grâce à la technologie de séquençage Oxford Nanopore. Innocent Drinks a apporté un financement complémentaire via son Farmer Innovation Fund, tandis que des partenaires de toute la filière banane ont participé à l'initiative.
Cette avancée intervient alors que l'industrie bananière mondiale est toujours confrontée à la pression du Fusarium wilt Tropical Race 4 (TR4) et du Black Sigatoka, deux maladies qui continuent d'impacter la production et d'engendrer des coûts de contrôle significatifs. Le pan-génome doit permettre une identification et une sélection plus précises des traits génétiques liés à la tolérance aux maladies et à l'adaptation aux changements climatiques.
Le professeur Gert Kema, membre du conseil d'administration de Yelloway et professeur émérite de phytopathologie à l'Université de Wageningen, explique :
« Imaginez le génome comme un paysage. Pour atteindre votre destination, il vous faut une carte. Jusqu'ici, nous roulions principalement sur les autoroutes, suffisantes pour atteindre les grandes villes. Mais pour atteindre chaque village, il faut des coordonnées GPS, des routes secondaires et parfois des pistes non goudronnées. Le pan-génome de la banane fournit cette carte haute résolution, nous permettant d'explorer pleinement l'ensemble du paysage génomique de la banane. »
Fernando Garcia-Bastidas, responsable du programme de sélection de bananes Yelloway, ajoute :
« Le pan-génome nous permet d'analyser, de sélectionner et de mobiliser le matériel génétique le plus pertinent. Il accélère considérablement le développement de variétés de bananes améliorées, résistantes aux menaces majeures comme le TR4 et le Black Sigatoka, des maladies qui mettent aujourd'hui en danger la banane telle que nous la connaissons. »
Peter Stedman, directeur développement durable chez Chiquita, déclare :
« Lorsque nous avons lancé Yelloway, nous savions que les connaissances générées dépasseraient largement notre organisation. La finalisation du pan-génome de la banane est une étape majeure, démontrant la valeur de la collaboration au sein de la filière et le potentiel de cette avancée pour la recherche et la sélection de bananes dans le monde entier. »
Le projet a été présenté lors de Fruit Logistica à Berlin, où les discussions ont porté sur la collaboration scientifique et l'innovation dans la chaîne de valeur de la banane.
Yelloway précise que les chercheurs académiques auront accès au pan-génome via un portail web dédié, afin de faciliter de nouvelles recherches et initiatives de sélection.
Pour plus d'informations :
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