En utilisant des outils d'édition de gènes récemment mis au point comme la CRISPR/Cas, les phyto-scientifiques ont pu comprendre les fonctions de tant de gènes végétaux. Bien que ces études pourraient éventuellement mener à la création de cultures à caractères améliorés, les chercheurs ont d'abord besoin d'un bon moyen de suivre les quantités de plus en plus importantes de données obtenues.
Pour répondre à ce besoin, les chercheurs de l'Institut Boyce Thompson ont mis au point la Base de données sur la révision du génome végétal (BDGVP) qui servira de dépôt central pour la gestion efficace des données sur les mutants végétaux, ainsi que de plateforme pour le partage des données et des mutants avec la communauté des chercheurs.
L'espoir ultime est que le PGED conduira à une utilisation plus efficace des ressources en réduisant le dédoublement inutile des expériences et en catalysant la collaboration entre les établissements de recherche. Pour aider à faire connaître la création de la base de données, les chercheurs ont récemment publié dans la revue Molecular Plant un appel à soumettre des données au PGED.
« Nous avons utilisé CRISPR/Cas pour faire plus de 430 lignes différentes, et cela uniquement pour la tomate. Au départ, le principal problème était de savoir comment tous les répertorier, c'était donc la principale motivation derrière la création de la base de données », explique Greg Martin de BTI, qui était l'auteur correspondant avec Zhangjun Fei de BTI. « De nombreux laboratoires de biologie végétale font de la recherche CRISPR/Cas ces jours-ci, et tout le monde va faire face à ce problème. »
Source : phys.org