Depuis l'été dernier, il existe sur le marché un kit de test qui permet aux producteurs de détecter rapidement, facilement et partout la présence du ToBRFV en phase pré-symptomatique. C'est que le virus n'apparaît pas que sur les plantes : voilà pourquoi, Spark Radar s'est efforcé d'étendre ses capacités de test. Outre les tests existants pour le ToBRFV, un test pour le virus de la marbrure du concombre (CGMMV) a été ajouté à la gamme.
S'appuyant sur le test ToBRFV pour le matériel foliaire, il existe désormais un test permettant de vérifier la présence du virus dans les semences, l'eau et sur les surfaces. Rogier van der Voort, cofondateur de la société, a annoncé cette nouvelle possibilité à la fin de l'année dernière.
Le matériel fourni par Spark Radar que les producteurs utilisent pour effectuer le test est le même pour chaque variante. Cela signifie qu'ils ne doivent pas faire d'investissement supplémentaire s'ils souhaitent utiliser une méthode de test différente, comme l'eau ou la surface. Les opérations initiales pour le test de l'eau sont différentes (collecter et filtrer l'eau est une toute autre chose que de pipeter le jus des feuilles), mais le principe reste le même.
Rapide
Le matériel standard utilisé pour effectuer le test est également le même pour les nouveaux tests. Spark Radar a développé un support magnétique et un support de détection. En utilisant le support magnétique, le testeur extrait le virus de l'échantillon, pour ainsi dire. « Cela garantit en partie la haute sensibilité de notre test. Même en présence d'une faible charge virale, le test détectera le virus. »
Une mise en garde importante concernant l'utilisation du test PCR rapide est que le résultat du test ne donne pas une réponse définitive quant à savoir si le virus trouvé est mort ou vivant. « Aucun test ne peut le faire jusqu'à présent. Pour cela, il faut vraiment faire un essai biologique », explique Van der Voort. Le fait est que les producteurs veulent tester rapidement et que notre test permet de le faire, même plus rapidement qu'en passant par un laboratoire.
Localisation et confinement des virus
La demande de tests depuis la production est élevée. On utilise les tests pour vérifier si le virus est présent après avoir nettoyé la serre suite à la culture, grâce à des échantillons d'eau, par exemple, mais surtout fréquemment pour garder le contrôle et limiter les dégâts, selon l'expérience de Rogier et de son partenaire Bas Rutjens. « Tant que le virus est abondant, il est nécessaire de trouver une solution permettant de détecter le virus à un stade pré-symptomatique. »
Les producteurs essaient autant que possible d'apprendre à travailler avec le virus. « Ce faisant, ils utilisent nos tests pour localiser le foyer et se servent de ces connaissances pour contenir l'infection du mieux possible. »
Test de dépistage du ToBRFV sur les semences
En nouveauté également : un test spécifique pour les semences. À la demande expresse d'un producteur italien, Spark Radar a également mis au point ces derniers mois un test pour les semences. Ce test permet de tester jusqu'à 500 semences à la fois. « La procédure d'analyse des semences est légèrement différente de celle des feuilles. En effet, pour détecter la présence du virus dans les graines, il faut plus de temps pour éliminer le virus des graines. Le matériel doit reposer pendant 12 heures dans le sac d'extraction tampon que nous fournissons avant que le test puisse être effectué », précise Van der Voort.
International
La demande de tests de dépistage du virus ToBRFV n'est certainement pas uniquement néerlandaise, même si, d'après les chiffres officiels, c'est là que le nombre d'infections semble être le plus élevé. Les Pays-Bas en comptent 50, selon les chiffres officiels les plus récents de la NVWA. Toutefois, le virus est également présent dans d'autres pays et la propagation se poursuit sur tout le globe.
Outre les Pays-Bas, Spark Rader a fourni des tests aux principales régions productrices de tomates en Europe, telles que la Belgique, la France et l'Italie, ainsi qu'aux États-Unis et au Canada. « En Amérique du Nord, le besoin d'un test ToBRFV pré-symptomatique fonctionnel est très important. Même dans le domaine de l'agriculture verticale, nous recevons des questions. Nous organisons actuellement de nombreuses démonstrations, au cours desquelles nous envoyons le premier kit de test avec le matériel nécessaire et effectuons ensuite le test en ligne, afin que les producteurs puissent utiliser le test de la meilleure façon possible. »
Selon Van der Voort, la détection précoce du ToBRFV est nécessaire pour éviter d'importantes pertes de rendement. « L'externalisation des tests prend souvent trop de temps et est coûteuse. Intégrer des tests périodiques dans le protocole permet d'éviter des pertes importantes. Outre le fait que les producteurs adaptent leur protocole et commencent à effectuer davantage de tests pré-symptomatiques, nous constatons qu'ils effectuent également davantage de tests à la porte d'entrée. » Par exemple, les producteurs testent le matériel végétal entrant avant de le planter. « Même sur de jeunes plants d'environ 30 centimètres de haut, nous avons constaté que le test peut révéler la présence du virus. »
Virus de la marbrure du concombre
Nombreux sont les producteurs de tomates qui ont commencé à cultiver des concombres en raison de la pression exercée par les virus. Mais là aussi, ils en rencontrent d'autres. Un virus bien connu est le virus de la marbrure du concombre (CGMMV). Comme annoncé à la fin de l'année dernière, Spark Radar dispose désormais d'un test pour ce virus. « Pour l'instant, il ne s'agit que d'un test sur feuilles, car nous voulons voir quelle est la demande pour ce test dans les mois à venir. Si la demande est au rendez-vous, nous proposerons d'autres options de test, comme nous l'avons fait pour le ToBRFV. »
Une aiguille dans une botte de foin
« Nous misons désormais sur ces deux virus avant d'ajouter de nouveaux virus et agents pathogènes à notre gamme de tests. Notre objectif est maintenant d'aider les producteurs à trouver une aiguille dans une botte de foin. Avec les options de test supplémentaires pour le virus ToBRFV, nous avons fait des progrès dans ce domaine. Par exemple, les producteurs prélèvent d'abord un échantillon d'eau et peuvent ensuite zoomer sur un échantillon de feuilles. Ils savent ainsi mieux où chercher le virus. »
Pour plus d'informations :
Rogier van der Voort
Spark Radar
rogier@sparkgenetics.com
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